pārvaldīt Saeimas un Ministru kabineta izveidotās īpaši aizsargājamās dabas teritorijas (turpmāk – aizsargājamā teritorija)
īstenot valsts dabas aizsardzības politiku, tai skaitā sugu un biotopu aizsardzības jomā
īstenot uzraudzības institūcijas funkcijas saskaņā ar normatīvajiem aktiem par starptautisko tirdzniecību ar apdraudētajām savvaļas dzīvnieku un augu sugām un savvaļas dzīvnieku turēšanu zooloģiskajos dārzos
īstenot kompetentās iestādes funkcijas saskaņā ar normatīvajiem aktiem par tirdzniecību ar izstrādājumiem no roņveidīgajiem
īstenot kompetentās iestādes funkcijas saskaņā ar normatīvajiem aktiem par ģenētiskajiem resursiem un to izmantošanu
īstenot kompetentās un koordinējošās iestādes funkcijas saskaņā ar normatīvajiem aktiem par invazīvu svešzemju sugu introdukciju un izplatīšanās profilaksi un pārvaldību
uzturēt un pilnveidot iestādes pārziņā esošo Latvijas nacionālās selekcijas augu šķirņu un vēsturisko kultivāru genofonda kolekciju un references kolekciju
piedalīties Latvijas floras izpētē un saglabāšanā, uzturēt un pilnveidot Latvijas savvaļas augu sugu genofonda kolekciju un references kolekciju
administrēt kompensāciju izmaksas par saimnieciskās darbības ierobežojumiem aizsargājamās teritorijās un mikroliegumos, kā arī zaudējumu atlīdzības izmaksas par īpaši aizsargājamo nemedījamo sugu un migrējošo sugu dzīvnieku nodarītajiem būtiskiem postījumiem
sertificēt sugu un biotopu aizsardzības jomas ekspertus un uzraudzīt sertificēto ekspertu profesionālo darbību, kā arī īstenot kompetentās iestādes funkcijas ārvalstīs iegūtās profesionālās kvalifikācijas atzīšanai un īslaicīgu profesionālo pakalpojumu sniegšanai sugu un biotopu aizsardzības jomas eksperta reglamentētajā profesijā
apsaimniekot Viedās administrācijas un reģionālās attīstības ministrijas valdījumā esošos valsts nekustamos īpašumus aizsargājamās teritorijās
ir tiesīgs atcelt iestādes amatpersonu izdotos administratīvos aktus un lēmumus, kā arī iekšējos normatīvos aktus
ir tiesīgs veikt vides valsts kontroli saskaņā ar Vides aizsardzības likumu
bez īpaša pilnvarojuma pārstāv iestādi